Δε μας λες τι χρήση ακριβώς θες να κάνεις, αλλά, όλα αυτά τα controllers λειτουργούν με όλα τα αντίστοιχα προγράμματα, όχι μόνο το Cubase (εκτός αν έχουν κάποια περίεργη ή πολύ καινούργια τεχνολογία). Αυτό που κάνουν αυτά τα controllers είναι να στέλνουν απλή midi πληροφορία.
Αν το συνδέσεις, μην περιμένεις να δουλεύει όπως ακριβώς θες. Θα χρειαστεί να πειράξεις αρκετά πραγματάκια, είτε στο ίδιο το controller, είτε στο plugin που θες να ελέγξεις, είτε απλά και μόνο να το ρυθμίσεις για να λειτουργεί "globally" στο πρόγραμμα (πχ να πατάς Play, Stop, Rec, κτλ).
Προσωπικά δεν έχω χρησιμοποιήσει κάποιο από αυτά τα δύο, αλλά το Maschine είναι σίγουρα προ-ρυθμισμένο για να λειτουργεί τέλεια με τα αντίστοιχα προγράμματα και plugins της Native Instruments (NKS). Αν είσαι φαν και τα χρησιμοποιείς πολυ, τότε ίσως αξίζει να του δώσεις μια ευκαιρία παραπάνω.
Η ΑΚΑΙ είναι γενικότερα μια αρκετά καλή εταιρία, αν και εγώ προσωπικά δεν είχα καθόλου καλή εμπειρία με το MPK Mini Mk2 (έσπασε το keybed με ελάχιστη χρήση).